核酸（かくさ
核酸（かくさん）は、塩基と糖、リン酸からなるヌクレオチドがエステル結合で連なった生体高分子。糖の違いによって DNA と RNA がある。糖の 1' には塩基が結合している。塩基であるアデニン、チミン (RNA ではウラシル)、グアニン、シトシンはそれぞれ A、T (RNA では U)、G、Cの一文字で表すことがある。このうち A と T (U)、および G と C が水素結合によって結合し塩基対を形成する。糖の 3' に隣の糖の 5' に結合したリン酸が結合することが繰り返されて長い鎖状になる。転写や翻訳は 5' から 3' への方向へ進む。
なお、糖鎖の両端のうち、5'にリン酸が結合して切れている側のほうを5'末端、反対側を3'末端と呼んで区別する。
核酸塩基
核酸塩基は核酸 (DNA, RNA) を構成する塩基成分で。アデニン、グアニン、シトシン、チミン、ウラシルなどがあり、それぞれ A, G, C, T, U と略す。構造の骨格からプリン塩基 (A, G) とピリミジン塩基 (C, T, U) とに分けられる。
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アデニン
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グアニン
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チミン
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シトシン
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ウラシル
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核酸やヌクレオチドの構成単位（の繰り返し数）として、たとえば、10塩基（1本鎖の場合）または10塩基対（2重鎖の場合）などと便宜的に用いる。
DNA塩基対
RNA塩基対
塩基対における水素結合
DNAの場合、アデニン(A)とチミン(T)、グアニン(G)とシトシン(C)は水素結合を形成する。AT対が2つの水素結合を形成するのに対し、GC対は3つの水素結合を形成する。そのため、GC含有量が大きい領域では安定性が高まる。略号のA+TがWeakの頭文字W、G+CがStrongの頭文字Sとなっているゆえんである。
一方、RNAは、アデニン(A)とウラシル(U)、グアニン(G)とシトシン(C)で塩基対を形成する。塩基としてチミンではなくウラシルで構成されるが、ウラシルもチミン同様ピリミジン骨格であり、アデニンと塩基対を形成する。
| 略号 | 塩基 (略称の由来) |
|---|---|
| A | アデニン (Adenine) |
| T | チミン (Tymine) |
| G | グアニン (Guanine) |
| C | シトシン (Cytosine) |
| U | ウラシル (Uracil) |
| R | プリン (puRine) |
| Y | ピリミジン (pYrimidine) |
| M | A あるいは C (aMino) |
| K | G あるいは T (Keto) |
| S | G あるいは C (G と Cの結合はStrong) |
| W | A あるいは T (A と Tの結合はWeak) |
| B | G あるいは T あるいは C (A の次はB) |
| H | A あるいは T あるいは C (G の次はH) |
| V | A あるいは G あるいは C (TU の次はV) |
| D | A あるいは G あるいは T (C の次はD) |
| N | AGTCのどれか (aNy) |
比較的広範囲で使われている略号を示した。分野によってはこれと異なった略号を用いることもある（修飾塩基など）。また、塩基とヌクレオシドを区別したい場合は三文字の略号を使う場合もある。
関連項目
- うま味
- ヌクレオチド
- 呈味性ヌクレオチド
外部リンク
- Nomenclature for Incompletely Specified Bases in Nucleic Acid Sequences